Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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ZNF548Q8NEK5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF548Q8NEK5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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