Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms