Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00301Q8NCQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms