Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF169Q8NCN4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF169Q8NCN4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF169Q8NCN4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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RNF169Q8NCN4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF169Q8NCN4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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