Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms