Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms