Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC24Q8N4L8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC24Q8N4L8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms