Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTBP4Q8N2S1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTBP4Q8N2S1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms