Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL1Q8IU54 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL1Q8IU54 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms