Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO2Q7Z6W1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO2Q7Z6W1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms