Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT28Q7Z3Y7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms