Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms