Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP1Q7RTM1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP1Q7RTM1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms