Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYFIP1Q7L576 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP1Q7L576 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms