Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms