Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms