Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms