Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3Q5K4L6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A3Q5K4L6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms