Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms