Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC93Q567U6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms