Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COBLL1Q53SF7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms