Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6CQ53S08 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms