Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms