Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms