Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms