Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms