Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms