Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CERKLQ49MI3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CERKLQ49MI3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms