Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms