Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms