Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDRF1Q3B7T1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms