Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TYSND1Q2T9J0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms