Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFX7Q2KHR2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX7Q2KHR2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms