Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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