Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GEN1Q17RS7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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