Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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