Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ME3Q16798 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME3Q16798 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME3Q16798 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME3Q16798 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME3Q16798 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME3Q16798 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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