Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms