Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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