Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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