Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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