Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNN3Q15417 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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