Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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