Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PRKD1Q15139 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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PRKD1Q15139 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PRKD1Q15139 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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