Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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COL19A1Q14993 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL19A1Q14993 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL19A1Q14993 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL19A1Q14993 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms