Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGB1Q14028 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGB1Q14028 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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