Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2H3Q13889 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms