Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
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