Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CDH18Q13634 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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