Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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